沪市指的是上海证券交易所，沪市的上市公司多为大型企业和国有企业，上市条件相对严格。深市指的是深圳证券交易所，深市上市公司以小型和中型企业为主，上市条件相对较松。两者的股票在股票代码、板块、交易制度、托管方式、B股标价、监管机构、市场规模、交易门槛、打新门槛上有一些区别，具体分析如下。
1、股票代码：沪市主板股票代码以60开头、科创板股票代码以688开头、B股股票代码以900开头；深市主板股票代码以000开头、中小板股票代码以002开头、创业板股票代码以300开头、B股股票代码以200开头。
2、板块不同：除主板和B股外，沪市有科创板；深市有中小板和创业板。
3、股本不同：沪市以大盘蓝筹股为主，满足国企上市的政治任务；深市主要是中小盘。
4、B股标价不同：沪市交易B股是以美元竞价；深市交易B股是以港币竞价。
5、托管不同：沪市是采取的指定交易，意思是投资者在设立证券帐户的时候要先选定一家证券公司作为委托对象；深市采取的“自动托管，随处通买，那买那卖，转托不限”。
6、新股上市停牌机制不同：沪市新股没有停牌机制，深市新股上市首日盘中涨幅与开盘涨幅之差首次达到10%时，临时停牌30分钟。
7、监管机构不同：沪市由中国证监会直接管理；深市由中国证监会深圳监管局监管。
8、市场规模不同：沪市上市公司数量有2000多家；深市上市公司数量有2800多家。
9、涨跌幅限制：沪市主板涨跌幅限制为 10%，科创板涨跌幅限制为20%；深市主板涨跌幅限制为 5%，创业板涨跌幅限制为20%。
10、交易门槛不同：沪深两市主板股票交易门槛一样，但科创板的交易门槛要高于创业板，两者都需要投资者有两年股票投资经验，科创板的资产要求为50万元，科创板则为10万元。
11、打新门槛不同：深A股的股票，新股申购需要连续20个交易日持有1万及以上的深市股票，投资者每持有深市股票市值5000元就可购买500股新股，每500股1个号码。沪A股的股票，新股申购需要连续20个交易日持有1万及以上的沪市股票，投资者每持有沪市1万元股票市值就可认购1000股新股，每1000股1个号码。
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